辦理水庫集水區崩塌處理、野溪整治、水土災害預警應變、削減集水區生活與農業汙染及監測護水等項目，達成集水區土砂減量入庫並改善水源水質目標。

• 主要於石門、曾文、南化、烏山頭、牡丹、白河、霧社、明德、德基、澄清湖、日月潭、仁義潭及阿公店等13座水庫集水區範圍，辦理集水區土砂減量入庫並改善水源水質。
• 迄今已減少2,800萬立方公尺土砂量流入水庫集水區河道，相當於2個鳥嘴潭人工湖的蓄水量，並辦理257處合併式淨化槽，改善集水區水體水質，使水庫永續經營並讓全民喝好水。